标题: 用Multiwfn分析aRDG报错 [打印本页] 作者Author: devil_lei 时间: 2017-4-23 18:31 标题: 用Multiwfn分析aRDG报错 用分子动力学计算一个配体和蛋白的复合物模型,固定配体,用Multiwfn分析aRDG,在计算格点的时候会在某一帧提示:
the promolecular density for the element with index of 106 has not been supported yet!
按照理解应该是不支持106号原子的状态密度,但是106号原子是普通的C原子,所以就不理解了。
请问大神,问题应该是出现在哪里,有没有解决方案。 作者Author: sobereva 时间: 2017-4-24 05:36
肯定是Multiwfn载入文件时候没能正确判断106号原子的实际元素。你载入后仔细看屏幕的提示,会告诉你当前体系元素组成,得确认无误才能做之后的事
如果是xyz轨迹文件,要确保里面原子名都是元素名。如果是pdb轨迹文件,只有当有元素那一列信息的时候,Multiwfn才能肯定判断对元素,否则只能根据原子名来猜,容易猜错。作者Author: devil_lei 时间: 2017-4-25 09:42
问题解决了,谢谢sob老师,是原子类型判断出了错误,改了就好了。