大家好,我是新手,想让作者大大看看我的流程对不对。
我算的是小分子,用VASP作弛豫和静态计算,随后使用Multiwfn LOCPOT得到LOCPOT.cub文件,然后Multiwfn LOCPOT.cub得到extrema.pqr和vtx.pqr文件,如附件所示。 (, 下载次数 Times of downloads: 0)
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将LOCPOT.cub,extrema.pqr和vtx.pqr导入vmd软件中。设置完毕后如图结果图所示。 (, 下载次数 Times of downloads: 0)
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现在有一个问题是:
vtx.pqr里面的color scale data range设置为20到48(vtx.pqr文件里都是正数,范围是22到52)
这样我画color bar的时候应该写20-48还是-20-48呢?
这样画图的流程到底对不对。还请大家帮忙解答一下。