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标题: 求助:TIP4P-FB水模型的参数修改问题 [打印本页]

作者
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oillio    时间: 3 day ago
标题: 求助:TIP4P-FB水模型的参数修改问题
1.老师们,这是我在amber99sb力场下的tip4p.itp的基础上,依据科音教材给出的TIPP-FB水模型的参数修改得到的tip4p-fb.itp。不知道正不正确,可否请老师们帮我看一下有无错误。
2.尤其是[ virtual_sites3 ]部分,我是将itp中末尾计算得到的const除以2得到的结果。a b这样算是正确的吗?(图1是添加的atomtypes部分。)
3.请问这种水模型与OPLS-AA或GAFF力场搭配使用效果如何?
感谢各位老师的解答。



作者
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sobereva    时间: 前天 02:39
直接用OPC.itp多好,好于TIP4P-FB,拓扑文件在北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/KGMX)的file文件包里都给了,培训里也明确讲了其具体用法

可以和你说的力场搭配




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