计算化学公社
标题:
有205个原子的分子在计算频率时退出
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作者Author:
lmyqwq
时间:
yesterday 14:13
标题:
有205个原子的分子在计算频率时退出
各位老师好,最近学生在计算一个有205个原子的分子时,前面优化的都是正常结束,但到了计算频率时总是退出。以前使用学校服务器算类似分子时,16、32G内存都可以,这次设为64G还不行,想问问各位老师这是什么原因导致的退出和有什么解决方法?
作者Author:
zjxitcc
时间:
yesterday 14:50
本帖最后由 zjxitcc 于 2025-8-12 14:52 编辑
解决报错 需要对症下药。g_write意思是硬盘满了,更确切地说是 Gaussian临时文件所在分区满了,不是内存不足。因此需要找出目标分区,清理临时文件目录。例如运行df -h查看哪个分区已占用99%、100%。也可以运行echo $GAUSS_SCRDIR直接显示Gaussian临时文件路径,该目录下的临时文件一般以Gau-xxx数字结尾,如果没有任何人在进行Gaussian计算,便可随意删除Gaussian临时文件;反之需要小心删除,避免删掉正在运行的Gaussian任务的临时文件,导致一些任务异常终止。
另外有两点建议:
(1)该体系较大,64GB内存不是很宽裕的设定,在机器物理内存允许的情况下,应当设置更多内存。
(2)输入文件关键词虽然没有错误,但浪费了一些机时。既然你之前已经完成几何结构优化,现在应当读取优化好的几何结构和对应的波函数,迅速进入freq计算步骤,输入文件示例
%chk=结构优化任务的chk文件名
%nprocshared=24
%mem=64GB
#p freq b3lyp chkbasis guess=read geom=allcheck
[空行]
[空行]
复制代码
这样做有两点好处,一是内容简洁无需写那么长的输入文件,无需再写一遍坐标,基组和赝势;二是读取坐标和轨道,避免重新构建SCF初猜、进行SCF迭代,节约时间。
作者Author:
lmyqwq
时间:
yesterday 17:50
zjxitcc 发表于 2025-8-12 14:50
解决报错 需要对症下药。g_write意思是硬盘满了,更确切地说是 Gaussian临时文件所在分区满了,不是内存不 ...
谢谢老师
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