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标题: 聚合物在npt之后模拟盒子中分布不均匀，有很多空隙 [打印本页]

作者
Author: huangzi 时间: 2025-8-1 22:04
标题: 聚合物在npt之后模拟盒子中分布不均匀，有很多空隙
各位好，向各位请教一下，我通过packmol对聚合物体系进行建模，相关itp文件sobtop导出，先进行了500psnvt过程，又进行了15ns的npt模拟，之后模拟盒子中有很多的空隙（未填充满盒子)，分布不均匀，所以想向各位请教一下这种情况应该怎么样处理 (, 下载次数 Times of downloads: 6)

作者
Author: sobereva 时间: 2025-8-1 22:20
没事甭写fourierspacing = 0.16 ，我见一次批一次

监控模拟过程中盒子尺寸的变化，如果还没平衡，继续跑。减小控压时间常数能让盒子更快达到平衡。至于其它的，没拓扑文件没法说

作者
Author: huangzi 时间: 2025-8-2 00:24

sobereva 发表于 2025-8-1 22:20
没事甭写fourierspacing = 0.16 ，我见一次批一次

监控模拟过程中盒子尺寸的变化，如果还没平 ...

好的老师我下次注意，这是我的输入文件。老师可以帮忙给看看吗

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