计算化学公社

标题: 用Multiwfn绘制的差分电荷密度图中有一半电荷不在原子上？ [打印本页]

作者
Author: Wyk_ 时间: 2025-7-14 09:32
标题: 用Multiwfn绘制的差分电荷密度图中有一半电荷不在原子上？
老师们，我按照使用Multiwfn作电子密度差图 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元中的步骤绘制的差分电荷密度图里蓝色部分不在原子上，看着像是按照某种方式对称后的。我也重新优化了整体和片段的结构，再次做了单点能计算，结果还是这样，请问应该怎么办？希望各位老师不吝赐教！感谢！
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作者
Author: 睡觉不打鼾 时间: 2025-7-14 10:59
看不出什么原因，盲猜一手没有用nosymm导致原子位置变动

作者
Author: pal 时间: 2025-7-14 11:04
是不是优化了片段结构

作者
Author: Wyk_ 时间: 2025-7-14 13:16

pal 发表于 2025-7-14 11:04
是不是优化了片段结构

不好意思说错了，没有优化片段结构

作者
Author: Wyk_ 时间: 2025-7-14 13:16

睡觉不打鼾发表于 2025-7-14 10:59
看不出什么原因，盲猜一手没有用nosymm导致原子位置变动

那我试一下，谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2025-7-15 06:03
认真看博文里nosymm的部分
整体和片段的原子坐标不对应的话，密度差图没有任何意义

作者
Author: Wyk_ 时间: 2025-7-15 14:06

sobereva 发表于 2025-7-15 06:03
认真看博文里nosymm的部分
整体和片段的原子坐标不对应的话，密度差图没有任何意义

好的！谢谢sob老师！

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