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标题: 单气体粒子穿过膜区域PMF不对称 [打印本页]

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Author: thor 时间: 2025-7-13 20:36
标题: 单气体粒子穿过膜区域PMF不对称
我用meta-eabf(colvar+gromacs)做单个气体粒子通过二维材料覆盖一层离子液体的膜(左侧为离子液体），发现出来的pmf收敛的两端不一样高，这是因为我的膜不对称造成的（如下图）？如果是的话，怎么解决这个问题？在公社中检索发现别人用伞形采样也遇到这个问题（求助：为什么气体穿膜正逆过程的PMF不相同 - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计算化学公社），应该是这种体系的问题吧。但我读的一些类似体系的文章并没有发现左右两个平台不一样高的问题
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