计算化学公社

标题: 求助:使用虚拟墙后分子在wall处排列 [打印本页]

作者
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baixiaoxuan    时间: 2025-7-7 14:37
标题: 求助:使用虚拟墙后分子在wall处排列
请问各位老师,设置了虚拟墙后为什么在模拟过程中,右侧分子(庚烷)在接触墙后没有被反弹回来,而是分子链伸直并整齐排列了(如结束图片所示),像是被墙吸上了?左侧水分子则没有这个现象。
如何避免这个现象呢,修改墙的参数吗怎么修改呢?

作者
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sobereva    时间: 2025-7-9 06:12
如果当前的WALL原子类型体现了wall和庚烷的色散吸引作用,wall就不仅仅起到互斥的作用了。若要纯粹起到互斥作用应当把WALL的C6参数设为0
作者
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baixiaoxuan    时间: 2025-7-9 16:51
sobereva 发表于 2025-7-9 06:12
如果当前的WALL原子类型体现了wall和庚烷的色散吸引作用,wall就不仅仅起到互斥的作用了。若要纯粹起到互斥 ...

谢谢老师。另外,请问老师,此现象是否会对体系总能量参数和界面张力的计算结果有影响呢?
作者
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sobereva    时间: 2025-7-9 22:55
baixiaoxuan 发表于 2025-7-9 16:51
谢谢老师。另外,请问老师,此现象是否会对体系总能量参数和界面张力的计算结果有影响呢?

多多少少会有




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