计算化学公社

标题: gromacs研究COF吸附Hgcl2，选择什么力场 [打印本页]

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作者
Author: 。。。    时间: 2025-7-3 21:31
标题: gromacs研究COF吸附Hgcl2，选择什么力场
各位老师好，我最近在研究一个COF材料吸附处理水中的Hgcl2，目前打算使用gromacs来做，但是我现在对于使用什么力场不是很清楚，现在目前我只知道COF可以使用GAFF力场，那对于体系中的Hgcl2应该使用什么力场呢，直接使用sobtop可以生成itp文件和top文件吗，麻烦各位老师帮我解答我的疑问，谢谢各位老师

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作者
Author: sobereva    时间: 2025-7-5 08:04
可以用sobtop产生基于UFF的拓扑文件

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作者
Author: GoldenBaby    时间: 2025-7-5 11:34
我记得有人单独给Hg2+优化过参数，你可以去找一找，UFF那套参数倒不是不能用，只能说优化的差强人意吧。

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作者
Author: 。。。    时间: 2025-7-5 14:41

sobereva 发表于 2025-7-5 08:04
可以用sobtop产生基于UFF的拓扑文件

好的好的，谢谢社长，我去试一试

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作者
Author: 。。。    时间: 2025-7-5 14:41

GoldenBaby 发表于 2025-7-5 11:34
我记得有人单独给Hg2+优化过参数，你可以去找一找，UFF那套参数倒不是不能用，只能说优化的差强人意吧。

谢谢你，我去找找看相关文献

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