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标题: 刚编译好的Windows版GROMACS 2025.2 (2025/08/03更新) [打印本页]

作者
Author: iuseroot 时间: 2025-5-21 09:19
标题: 刚编译好的Windows版GROMACS 2025.2 (2025/08/03更新)
本帖最后由 iuseroot 于 2025-8-3 22:11 编辑

更新：
2025/08/03：
1. 应各位网友要求，更新了新的下载链接，有效期1个月。
2. CUDA版本提升至12.8.1，使用50系显卡的网友可以尝试能否正常运行（我没有50系显卡所以无法测试）。

基于GitHub Actions自动化编译，编译器最新版MSVC，保障与Windows的原生兼容性。

运行的操作系统：Windows 10 64-bit 或 Windows 11。
CPU要求：支持AVX2指令的x86_64 CPU （CUDA版也需要满足）。

集成了 FFTW (3.3.10) OpenBLAS (0.3.29) 和 hwloc 。
集成了 CHARMM36 力场（版本：July 2022）。

使用 OpenMP 并行，没有使用 MPI，因此也无需安装任何MPI库。（因为只考虑单台Windows上多线程并行，所以 OpenMP 可以完全可以满足）
没有集成 PLUMED，也没有集成 libtorch （所以 Neural Network potential 是不支持的）

CPU版本同时包含了单精度的 gmx.exe 和双精度的 gmx_d.exe 。
CUDA版本只包含单精度的 gmx.exe ，要求系统内安装了 CUDA 12.8.1 或更高版本（因此N卡驱动应该是 572.61 或更高的版本）

关于性能：
我只有一个粗略的结果，仅供参考。
CPU版本：因为MSVC的原因，Windows版显著比Linux版慢很多，所以不建议使用Windows上的CPU版。建议此处提供的CPU版仅用于测试（例如短时间运行测试自己做的tpr能不能跑起来）
CUDA版本：在Windows上原生运行的性能和在WSL中运行Linux版性能几乎一致。与原生Linux系统上运行，大约Windows原生版大约只有90%的性能（也就是说跑5天还是跑5天半的区别）。所以Windows原生的CUDA版GROMACS是完全可以接受的，特别是对于机器有限，不方便装Linux的用户而言。

CUDA版下载（需要登录GitHub账号，有效期至2025/09/02）：
（文件名称忘了修改了：写的是cuda1263实际应该是cuda1281，因此请确定系统内的CUDA版本需要是12.8.1或更高版本）

https://github.com/KaneGreen/GROMACS-Windows-Builder/actions/runs/16702746939/artifacts/3675975569

复制代码

CPU版下载（需要登录GitHub账号，有效期至2025/09/02）：

https://github.com/KaneGreen/GROMACS-Windows-Builder/actions/runs/16700634341/artifacts/3675498234

复制代码

GitHub项目链接：

https://github.com/KaneGreen/GROMACS-Windows-Builder

复制代码

欢迎提出issues和PR。
Fork后自行编译的朋友请注意GitHub用户协议，请勿滥用GitHub Actions。

作者
Author: neocc 时间: 2025-5-22 15:14
请问没有plumed，colvar可以用吗

作者
Author: iuseroot 时间: 2025-5-29 11:19

neocc 发表于 2025-5-22 15:14
请问没有plumed，colvar可以用吗

取决于你需不需要这两个模块的功能，不需要用到它们的话就可以用

作者
Author: 小马仙人 时间: 2025-6-2 02:03
博主，请问下50系显卡用你的gmx_cuda版本在做限制动力学模拟时出现如下问题，该怎么解决啊

作者
Author: iuseroot 时间: 2025-6-5 00:06

小马仙人发表于 2025-6-2 02:03
博主，请问下50系显卡用你的gmx_cuda版本在做限制动力学模拟时出现如下问题，该怎么解决啊

根据论坛上其他的贴子，可能是我这里用的CUDA版本是12.6，而50系要求12.8
我这里没有50系显卡，我还没有测试

作者
Author: 小马仙人 时间: 2025-6-5 01:20

iuseroot 发表于 2025-6-5 00:06
根据论坛上其他的贴子，可能是我这里用的CUDA版本是12.6，而50系要求12.8
我这里没有50系显卡，我还没有 ...

谢谢啦，我在wsl里安装了最新版本的，能够成功运行了

作者
Author: loovfnd 时间: 2025-6-27 15:39
不能下载了呀。

作者
Author: 大王来何 时间: 2025-6-27 23:34
还能分享一次吗

作者
Author: jlzhang 时间: 2025-7-17 10:18
可以再次分享吗，谢谢了

作者
Author: iuseroot 时间: 2025-8-3 22:12
本帖最后由 iuseroot 于 2025-8-3 22:13 编辑

loovfnd 发表于 2025-6-27 15:39
不能下载了呀。

@loovfnd @大王来何 @jlzhang
已补档

作者
Author: 大王来何 时间: 2025-8-5 10:18

iuseroot 发表于 2025-8-3 22:12
@loovfnd @大王来何 @jlzhang
已补档

收到感谢大佬

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