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标题: 在cp2k中如何理解QMMM盒子 [打印本页]

作者
Author: ljc2877437407 时间: 2025-5-7 21:50
标题: 在cp2k中如何理解QMMM盒子
sob老师以及各位老师好，本人初学cp2k，对于在qmmm定义盒子大小有点难以理解，比如我在进行qmmm计算时会定义两个盒子，一个是整个体系的盒子，另外一个是qm部分的盒子，而且在计算中通常会要求把qm部分居中在qm盒子里，此时就会造成体系平移，那么在MM部分的原子就会移出到整个体系盒子的外面，请教一下这会产生什么影响嘛，比如我下面画的示意图

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作者
Author: sobereva 时间: 2025-5-7 21:56
MM在盒子外面没有任何关系，本来就用了PBC。另外，QM的盒子的原点也不是和MM的盒子一致的，CP2K的周期性QM/MM的细节见J. Chem. Theory Comput., 2, 1370-1378 (2006)

作者
Author: ljc2877437407 时间: 2025-5-7 21:59

sobereva 发表于 2025-5-7 21:56
MM在盒子外面没有任何关系，本来就用了PBC

谢谢sob老师

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