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标题: VMD把所有原子隐去不了 [打印本页]

作者
Author: shiyuyang 时间: 2025-4-24 18:48
标题: VMD把所有原子隐去不了
本帖最后由 shiyuyang 于 2025-4-24 22:13 编辑

我用Multiwfn计算孔隙，在VMD打开.cub格式，想把原子信息全部隐去，只保留孔隙部分，请问选择了none为什么还是不可以？请问图中的这些线代表什么？
使用老师的教程：使用Multiwfn图形化展示分子动力学模拟体系中的孔洞、自由区域
http://sobereva.com/539（http://bbs.keinsci.com/thread-16491-1-1.html） (, 下载次数 Times of downloads: 13)

想要达到下面这个效果 (, 下载次数 Times of downloads: 13)

作者
Author: pal 时间: 2025-4-24 20:55
在上面点两下变红不就不显示了，其中一个CPK已经红了不显示，再把Lines和另一个CPK点红

作者
Author: shiyuyang 时间: 2025-4-24 22:07
本帖最后由 shiyuyang 于 2025-4-25 10:50 编辑

pal 发表于 2025-4-24 20:55
在上面点两下变红不就不显示了，其中一个CPK已经红了不显示，再把Lines和另一个CPK点红

明白了感谢解答！

作者
Author: sobereva 时间: 2025-4-24 23:00
除了显示等值面的那个rep外的其它rep全都双击变成红色（不显示状态）

作者
Author: shiyuyang 时间: 2025-4-25 09:33

sobereva 发表于 2025-4-24 23:00
除了显示等值面的那个rep外的其它rep全都双击变成红色（不显示状态）

老师都变成红色也还是去不掉，请问是我的文件有问题吗。
我对lammps生成的.xyz文件提取一帧，用Atomsk -ow 转成.pdb，用Multiwfn算孔隙保存.cub。麻烦老师帮看看这三个文件格式有啥问题吗？
(, 下载次数 Times of downloads: 13) (, 下载次数 Times of downloads: 13) (, 下载次数 Times of downloads: 14) (, 下载次数 Times of downloads: 11)

作者
Author: sobereva 时间: 2025-4-25 09:57

shiyuyang 发表于 2025-4-25 09:33
老师都变成红色也还是去不掉，请问是我的文件有问题吗。
我对lammps生成的.xyz文件提取一帧，用Atomsk - ...

第一个rep你都没弄成红色当然没隐去

作者
Author: shiyuyang 时间: 2025-4-25 10:17
本帖最后由 shiyuyang 于 2025-4-25 10:47 编辑

sobereva 发表于 2025-4-25 09:57
第一个rep你都没弄成红色当然没隐去

好了谢谢老师解答！

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