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标题: 求助：请问packmol如何让分子平移复制呢 [打印本页]

作者
Author: Lisy 时间: 2025-4-17 16:19
标题: 求助：请问packmol如何让分子平移复制呢
我想用packmol 构建一个多层二维COF纳米片的结构，我构建了单独一层COF的力场，现在我用packmol建模想构建三片COF片互相平行排列的模型，请问各位老师应该如何构建呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-4-17 16:45
如果有盒子信息，简单的平移复制用gmx genconf最容易
非要用packmol，你得自定义中心的位置、对旋转设置约束

作者
Author: boqiang 时间: 2025-4-18 10:39
gromacs中也有平移，-translate x y z

作者
Author: CrysW555 时间: 2025-4-18 12:22
就分别设置三个单层，center fix，就相当于平移复制了

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