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标题: gmx_MMPBSA报错UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode [打印本页]

作者
Author: yixiansheng 时间: 2025-4-15 20:05
标题: gmx_MMPBSA报错UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode
我在linux的机子上安装了gmx_MMPBSA，gmx_MMPBSA -O -i pmf.in -cs umbrella20.tpr -ci 3.ndx -ct umbrella20.xtc -cp topol.top -o result.dat -cg 9 10使用这个指令后始终报错UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode byte 0xc5 in position 280: invalid continuation byte，Exiting. All files have been retained.
改为-cg 0 1就会报错体系中存在水分子（我知道计算的时候不能有水，尝试一下），index中9和10group是使用gmx make_ndx后自己加的，0 1就是system和water。想问一下这是什么原因，是我软件编译的问题吗

作者
Author: yixiansheng 时间: 2025-4-16 11:39
已解决，把拓扑文件转码一下即可

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