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标题: (已解决)top文件和gro文件原子数目不匹配,多了20个原子 [打印本页]

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horno    时间: 2025-4-11 10:20
标题: (已解决)top文件和gro文件原子数目不匹配,多了20个原子
本帖最后由 horno 于 2025-4-11 10:32 编辑

用sobtop生成了一个.top文件,能量最小化之后报错:number of coordinates in coordinate file (TA-CNT-box.gro, 968) does not match topology (TA.top, 988)。根据分子数目来算应该就是968个,不知道为什么top文件会多20个,求各位大佬解答 (, 下载次数 Times of downloads: 2)
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pal    时间: 2025-4-11 10:28
TA:69个原子,CNT:160个原子,top里面:TA12个,CNT1个,总原子数:160+69*12=988,gro文件里的CNT少了20个原子
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horno    时间: 2025-4-11 10:31
pal 发表于 2025-4-11 10:28
TA:69个原子,CNT:160个原子,top里面:TA12个,CNT1个,总原子数:160+69*12=988,gro文件里的CNT少了20 ...

好的,谢谢了




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