计算化学公社

标题: 求助，gmx结合能计算的时候静电力一直为0 [打印本页]

作者
Author: aaapril1st 时间: 2025-3-28 11:02
标题: 求助，gmx结合能计算的时候静电力一直为0
请教一下大家，我做的是蛋白配体100ns的模拟，模拟完成后无论是GMX自带的计算库仑力的命令还是MMPBSA，算出来的静电力都是0，而其他几个力是正常的，请问是哪里有可能出现问题呢

作者
Author: sobereva 时间: 2025-3-28 12:09
要么操作不对，要么配体的拓扑文件里没定义原子电荷

不要乱用“力”字，看
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298（http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html）

作者
Author: aaapril1st 时间: 2025-3-28 16:13

sobereva 发表于 2025-3-28 12:09
要么操作不对，要么配体的拓扑文件里没定义原子电荷

不要乱用“力”字，看

非常感谢老师的提醒，检查了一下可能是我输入sobtop的mol2文件没有计算电荷

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