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标题: 结晶过程的分子动力学研究，模拟软件选择及模拟思路的求助 [打印本页]

作者
Author: 1984901858 时间: 2025-3-25 15:14
标题: 结晶过程的分子动力学研究，模拟软件选择及模拟思路的求助
课题组在做聚合物和大分子的晶体学研究，制备手段为旋涂。现在想知道衬底上薄膜/块体材料中一些结构存在的原因，因此想开展结晶过程的分子动力学研究，未来可能开展力学和热学性能方面的模拟。导师把这课题交给我，我原来不是搞模拟的，所以来这里问问大家：
1.哪个软件能实现研究目的？包括免费和付费的。
2.如何建立模型。先建立非晶结构还是直接实验得到的结构。
已有硬件方面条件：7950X+4080+windows
谢谢大家。

作者
Author: Graphite 时间: 2025-3-25 16:04
1、gromacs和lammps，先学gromacs上手更快，力学和热学一些较为复杂的、需要专门定义的量lammps。
2、具体问题具体分析，主要得对真实结构脑子里有一个图像。

先看同方向的文献确定具体的建模手段、模拟范式、关键指标、实现路径等。一般而言你还需要的技术栈还有linux、python、拓扑工具（sobtop、autoff等）、建模工具（packmol、moltemplate、自己写建模脚本等）。并且随时做好补理论的准备，包括模拟本身，包括相关的力学和热学如何应用到模拟中。

作者
Author: atomrq 时间: 2025-3-26 14:51
大分子/聚合物做结晶基本很难很难，仅有PE这种简单的体系在特定力场下才能得到结晶结果。因为结晶涉及的尺度大，而模拟很难在结构和模拟时间上达到结晶的要求。
如果是界面上的结晶可能由于吸附作用，可能会好做一点。总之体相的几乎不可能做的出来明显的大分子结晶。

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