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标题: MOMAP计算分子重组能异常 [打印本页]

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Author: 804719194 时间: 2025-3-22 09:53
标题: MOMAP计算分子重组能异常
(, 下载次数 Times of downloads: 7)

(, 下载次数 Times of downloads: 7) 各位大佬，小弟在使用momap做振动耦合计算的时候发现重组能大的有些异常，求助可能的原因是什么？

作者
Author: wal 时间: 2025-3-22 10:23
有可能是结构变化太大破坏谐振近似了

作者
Author: 804719194 时间: 2025-3-22 15:59

wal 发表于 2025-3-22 10:23
有可能是结构变化太大破坏谐振近似了

好的，感谢解答

作者
Author: 李永航 时间: 2025-5-7 09:53
同问，RMSD=0.45，变化很小。重组能7万

作者
Author: cokie 时间: 2025-5-7 12:09

李永航发表于 2025-5-7 09:53
同问，RMSD=0.45，变化很小。重组能7万

momap 出两个重组能，一个是基于笛卡尔坐标的（cart），一个是内坐标的（int），如果这两个输出结果相差较小，则选用笛卡尔坐标所输出的重组能，否则就使用内坐标输出的重组能

作者
Author: 李永航 时间: 2025-5-7 17:05

cokie 发表于 2025-5-7 12:09
momap 出两个重组能，一个是基于笛卡尔坐标的（cart），一个是内坐标的（int），如果这两个输出结果相差 ...

内坐标输出的是7万，直角坐标输出的是百万级别的，两个结果貌似都不合理

作者
Author: 804719194 时间: 2025-5-7 17:18

李永航发表于 2025-5-7 17:05
内坐标输出的是7万，直角坐标输出的是百万级别的，两个结果貌似都不合理

体系是不是有柔性链？不行的话貌似只有重新优化了

作者
Author: slxc920113 时间: 2025-5-7 17:42
两个态的原子顺序保持一致，建议优化完S0，再用S0的结构作为初始输入的结构优化T1或者S1。如果仍然很大，可能激发态优化到了另一个FrankCondon区间，可以用激发态的结构作为输入，重新优化S0.

作者
Author: 李永航 时间: 2025-5-7 19:48
是柔性八元环结构，感谢大神，我再去尝试重新优化。

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