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标题: 求助Sobtop指认原子类型时，报错Unrecognized atom name( ?. [打印本页]

作者
Author: joojoseph 时间: 2025-3-20 16:21
标题: 求助Sobtop指认原子类型时，报错Unrecognized atom name( ?.
本帖最后由 joojoseph 于 2025-3-20 16:21 编辑

输入文件是GaussView生成的mol2文件，在使用sobtop产生拓扑文件时报错：Unrecognized atomic name ( ?.
文件已上传，望大佬们指点。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-3-20 18:01
当前情况非常特殊，是Zr成键过多所致。在gview里把Zr-Zr键都删掉，重新保存mol2，就可以了，改后的在这里：
(, 下载次数 Times of downloads: 4)

那些Zr-Zr键没有必要留着

作者
Author: joojoseph 时间: 2025-3-20 18:12

sobereva 发表于 2025-3-20 18:01
当前情况非常特殊，是Zr成键过多所致。在gview里把Zr-Zr键都删掉，重新保存mol2，就可以了，改后的在这里： ...

原来如此，太感谢了！

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