标题: 求助MD模拟萃取的热力学平衡与动力学平衡判定 [打印本页] 作者Author: sxj886 时间: 2025-3-12 11:21 标题: 求助MD模拟萃取的热力学平衡与动力学平衡判定 老师好，我通过MD模拟研究萃取过程，审稿人在审稿时提出： It is mentioned the extraction process reaches dynamic equilibrium. First, it should be thermodynamic equilibrium, shouldn't it? Second, can you compare the equilibrium from simulation with other reported calculations using equation of state or simulations? 对于这个问题，我们的回答是：给出了MD模拟过程中能量和温度随时间的变化曲线图。并且，在0.6 ns之后，能量和温度随时间略有波动，且几乎呈直线变化。所以系统达到了热力学平衡。系统在50 ns后完全分相，各组分的自扩散系数也趋于稳定。这表明系统达到了动态平衡。综上所述，所研究的系统的热力学和动力学性质都达到了平衡。
然而审稿人再审后，让我们清晰地显示均衡时期的波动。因此，我给出了模拟最后50ns（平衡后）的能量变化图，如下，是否能量的波动过于剧烈，存在问题。审稿人还指出，对这个问题的部分回答，“系统达到热力学平衡，然后是动态平衡”，是不正确的。
目前，对于这个问题没有什么好的思路进行回答，敬请各位老师大佬指导！