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标题: 利用charmm-gui建膜蛋白结构，结果有残基飘散到磷脂边缘了怎么办 [打印本页]

作者
Author: NEW12138 时间: 2025-3-7 09:48
标题: 利用charmm-gui建膜蛋白结构，结果有残基飘散到磷脂边缘了怎么办
如题：利用charmm-gui建膜蛋白结构，结果有残基飘散到磷脂边缘了怎么办 (, 下载次数 Times of downloads: 22)

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Author: wake19 时间: 2025-3-7 15:24
要不要试试优化膜系统参数，比如调整膜的横向尺寸

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Author: NEW12138 时间: 2025-3-7 16:16

wake19 发表于 2025-3-7 15:24
要不要试试优化膜系统参数，比如调整膜的横向尺寸

谢谢，好像是系统的bug，我重新导入pdb文件之后生成的膜没有这个问题了

作者
Author: NEW12138 时间: 2025-3-7 16:19

wake19 发表于 2025-3-7 15:24
要不要试试优化膜系统参数，比如调整膜的横向尺寸

还有可能是charmm-gui的周期性呈现？我发现网上有其他的人也有这样的情况

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