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标题: cp2k 25.1在超算上跑656个原子体系的单点计算会异常中断 [打印本页]

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gagatom    时间: 2025-2-19 16:34
标题: cp2k 25.1在超算上跑656个原子体系的单点计算会异常中断
超算上安装的是cp2k 25.1,用小体系测试了一下,cp2k是可以正常运行的。于是换上600多个原子的异质结的体系想进行预优化,但是每次运行都会中断,如下图所示。

我尝试了用32核,96核并行计算都算不动,似乎不是cpu的问题。slurm.out给出以下报错信息,不知道是不是内存的问题?想请问各位老师,有没有什么解决办法?

以下是输入文件、输出文件、提交作业的脚本。刚接触cp2k,不太懂的地方,麻烦各位老师多多指教,感谢!

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sobereva    时间: 2025-2-19 17:29
那叫2025.1,别乱写

光从当前信息难以判断
只考虑gamma点看看情况
也可能编译或软件环境有问题

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gagatom    时间: 2025-2-19 19:23
sobereva 发表于 2025-2-19 17:29
那叫2025.1,别乱写

光从当前信息难以判断

谢谢sob老师,只考虑gamma点还是不行,我打算重新编译一下
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reid    时间: 2025-2-20 20:39
我试了下,我的2024.3能跑,为了省时间,把k点改成221,看来是你编译的问题。这么大的尺寸,建议用OT。
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gagatom    时间: 2025-2-23 01:16
reid 发表于 2025-2-20 20:39
我试了下,我的2024.3能跑,为了省时间,把k点改成221,看来是你编译的问题。这么大的尺寸,建议用OT。

谢谢,确实是编译的问题,改用自己编的gcc和openmpi,就可以成功编出cp2k了。这个体系也能成功跑了。




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