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标题: 请教老师零价铑金属配合物的CDA分析遇到的问题 [打印本页]

作者
Author: 小乖打怪兽 时间: 2025-2-19 09:45
标题: 请教老师零价铑金属配合物的CDA分析遇到的问题
老师，您好！问题1：我想做一个零价铑金属配合物的CDA分析（一个铑金属配了两个双膦配体，双膦配体是一样的），那么划分选取片段的时候定义三个片段，两个双膦配体分别为片段1和片段2（闭壳层），一个零价铑为片段3（开壳层），或者一个双膦配体加上一个铑原子为片段1（开壳层），另外一个双膦配体作为片段2（闭壳层），想问下老师我哪种片段选取比较合适呀（铑上的两个双膦配体是一模一样的）？
问题2：我先是尝试第一种划分，即3个片段，但是在进行分析时遇到如下情况，请问老师怎么解决呀？
Loading basic information of this fragment...Please waitAlpha electrons:Beta electrons:113Multiplicity:1113The number of basis functions in this fragment:56858The number of atoms in this fragment:
Maximum deviation of atomic coordinate between fragment and complex:
2.713 Angstrom
Warning: The coordinate of the fragments deviates from the complex distinctly! The result may be fully meaningless. please check input files of your quantum chemistry code to make the coordinate of the fragments fully consistent with the complex. If you are a Gaussian user, please do not forget to add "nosym" to avoid automatically translating and rotatingthe system to standard orientationPress ENTER button to continue

我在进行片段计算也都写上nosymm关键词，如下：
（%nprocshared=8
%mem=14000MB
%chk=CDA-part1.chk
# def2svp pbe1pbe nosymm

CDA-part1）
不知道是什么原因，望老师解答，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2025-2-19 10:33
1 取决于自己的研究目的，需要考察谁和谁的相互作用

2 下文说得没法更清楚
使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图
http://sobereva.com/166

输入文件里片段的坐标必须和复合物坐标一致，因此片段的坐标只需要从已优化的复合物的坐标中直接提取出来就行了，不要单独对片段进行优化。对于Gaussian用户，为了避免Gaussian自动将坐标调整到标准朝向而使得坐标无法相互对应，应当恰当使用nosymm关键词，见《谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用》（http://sobereva.com/297）。如果为了保险，就在所有计算时都写上nosymm关键词

又不是光写个nosymm就完事了。每个字都看清楚。倘若gjf里的片段的坐标就和复合物不对应当然做不了CDA，无论写不写nosymm

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