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标题: 关于CP2K对周期性体系结构优化报错的问题 [打印本页]

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Author: alenrose 时间: 2025-1-6 16:08
标题: 关于CP2K对周期性体系结构优化报错的问题
各位老师好，我想对一个周期性晶体体系计算声子谱。首先，是对该晶体的原胞进行晶胞不变的结构优化，使用较严阈值，基组采用pob-TZVP-rev2,我看晶胞参数较大，k点设置了2，1，1（最开始设置4，4，4）均出现下面的报错。请问是基组设置太大还是k点不对，还是其他问题，以下是我的输入文件和晶体cif文件

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Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-1-6 16:27
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2025-1-6 16:30 编辑

这结构是怎么获得的呢，看起来有两个奇怪之处：一是锰原子裸露着且周围的空间不小，二是锰离子和四芳基鏻离子没有平衡电荷的阴离子。

编辑：简体“𬭸”（⿰钅粦）字似乎显示不出来，暂时换成繁体

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Author: alenrose 时间: 2025-1-6 16:37

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-1-6 16:27
这结构是怎么获得的呢，看起来有两个奇怪之处：一是锰原子裸露着且周围的空间不小，二是锰离子和四芳基鏻离 ...

对这个是我师姐自己的材料，磷是有机阳离子

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Author: alenrose 时间: 2025-1-6 16:46

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-1-6 16:27
这结构是怎么获得的呢，看起来有两个奇怪之处：一是锰原子裸露着且周围的空间不小，二是锰离子和四芳基鏻离 ...

老师，我这个有办法优化吗

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Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-1-6 17:02

alenrose 发表于 2025-1-6 16:37
对这个是我师姐自己的材料，磷是有机阳离子

对啥对啊，从基础的化学常识都看得出，毫无配位的裸露锰离子根本不可能在晶体中稳定存在，阳离子聚集的结构更是因静电斥力而直接库伦爆炸了。这种体系能跑通才怪了，就算能计算出数据也实在意义不明。

实验合成的晶体材料肯定不长这样，结构里必然有平衡电荷的阴离子存在，锰离子周围必然有一圈配体（溶剂分子或者阴离子或者其他配体之类）。现在最要紧的事情是跟解出这个结构、下发文件和计算任务的人好好谈谈，搞清楚有意义的现实的结构长什么样，然后再说几何优化怎么操作。

另外也推荐读一读这篇社长博文。
实验测定分子结构的方法以及将实验结构用于量子化学计算需要注意的问题
http://sobereva.com/569

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Author: alenrose 时间: 2025-1-6 17:20

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-1-6 17:02
对啥对啊，从基础的化学常识都看得出，毫无配位的裸露锰离子根本不可能在晶体中稳定存在，阳离子聚集的结 ...

好的好的

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