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标题: 求教：两条六肽之间的相互作用研究 [打印本页]

作者
Author: huanyizhen 时间: 2014-12-22 21:52
标题: 求教：两条六肽之间的相互作用研究
如题：我想用gaussian计算两条六肽之间的相互作用，两条六肽之间是平行或者反平行的关系。我用M06-2X/6-31G*来优化结构和计算freq。想问一下还可以用gaussian计算哪些东西来研究两条链间的相互作用？（比如NBO分析之类的？）

作者
Author: sobereva 时间: 2014-12-22 22:14
建议用6-31+G*，这是计算弱相互作用最低限度的基组。
如果计算能力不足，可用PM7在MOPAC2012下初步优化，进而在BLYP-D3下用orca优化，参考此文
大体系弱相互作用计算的解决之道
http://sobereva.com/214

弱相互作用分析方法见
Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252

NBO对于弱相互作用分析没什么用，而且还有误导性。

作者
Author: huanyizhen 时间: 2014-12-23 14:26
多谢sob:):lol

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