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标题: Multiwfn+VMD 绘制阴离子ESP问题求助 [打印本页]

作者
Author: TTgyt 时间: 2024-11-28 15:27
标题: Multiwfn+VMD 绘制阴离子ESP问题求助
根据社内博文内容，利用VMD+Multiwfn绘制了有关阴离子体系的ESP图（iso）
根据Multiwfn分析的结果调整了Graphical Representations-Trajectory-color scale data range，但图像显示是一圈一圈的（我也调节了Material里的opacity等参数），效果不是很好。
请问各位老师们这是什么原因呢？ (, 下载次数 Times of downloads: 24)

作者
Author: sobereva 时间: 2024-11-28 17:08
别自己写[Multiwfn使用咨询]这种标签，给你去了，以后注意！

作者
Author: sobereva 时间: 2024-11-28 17:19
没细节信息没法说，严格照着下文操作，别额外手动改设置（至少把改过的都交代出来）
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）
http://sobereva.com/443（http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html）

作者
Author: TTgyt 时间: 2024-11-29 09:57

sobereva 发表于 2024-11-28 17:08
别自己写[Multiwfn使用咨询]这种标签，给你去了，以后注意！

好的老师！下次一定注意！

作者
Author: TTgyt 时间: 2024-11-29 10:08

sobereva 发表于 2024-11-28 17:19
没细节信息没法说，严格照着下文操作，别额外手动改设置（至少把改过的都交代出来）
使用Multiwfn+VMD快速 ...

老师我并没有额外手动改什么设置，打开VMD输入iso后，阴离子体系显示的是全蓝的，然后就是按照Multiwfn计算出的结果，将color scale data range改为了-0.21--0.19（BF4-），显示出的颜色就不太均匀，然后将Material改为了Transparent，opacity我调到了0.51，就是如图所示的效果。另外之前绘制TFSI阴离子时没有遇到这个情况，主要就出现在BF-、ClO4-和NO3-的绘制过程中。

感谢老师解答！

作者
Author: sobereva 时间: 2024-12-2 05:23

TTgyt 发表于 2024-11-29 10:08
老师我并没有额外手动改什么设置，打开VMD输入iso后，阴离子体系显示的是全蓝的，然后就是按照Multiwfn计 ...

跟体系有关，是当前体系静电势的等值面与电子密度等值面的形状过于接近所致。可以考虑加大电子密度等值面的数值（此时ESPiso.bat里的-ESPrhoiso 0.001需去掉然后重算）。另外，减小格点间距（即增加格点数）也可以一定程度令图像效果好点。

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