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标题: 求助：如何统计沿某一方向的离子扩散系数分布 [打印本页]

作者
Author: abing 时间: 2024-7-4 19:53
标题: 求助：如何统计沿某一方向的离子扩散系数分布
请问各位老师，怎么得到如文献所示的离子扩散系数沿某一方向或者是在二维平面上的分布呢？
我尝试使用VMD中unwrap命令消除周期性边界条件，之后使用VMD提供的Diffusion Coefficient命令计算扩散系数，但趋势和文献吻合不上。
所参考文献是《Molecular Dynamics Simulations of Water Structure and Diffusion in Silica Nanopores》

作者
Author: sobereva 时间: 2024-7-5 09:39
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作者
Author: abing 时间: 2024-7-5 10:46

sobereva 发表于 2024-7-5 09:39
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好的好的，谢谢sob老师

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