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标题: 怎么用vmd复制并平移分子 [打印本页]

作者
Author: Sunca 时间: 2024-7-2 23:13
标题: 怎么用vmd复制并平移分子
我想建成像图中一样的模型，作者文章里面说是用vmd复制平移得到的，平移我会，但是怎么复制呢？
或者有其他方法可以实现吗？求大佬指点

作者
Author: sobereva 时间: 2024-7-3 08:54
没法平移复制
可以平移一次保存一次xyz文件，最后自行合并

作者
Author: dayu8278 时间: 2024-7-3 08:58
用pymol可以的

然后对目标实施平移，用命令，别手动，这样可以的，效果不错

作者
Author: 乐平 时间: 2024-7-3 11:28
GaussView 可以

（1）建立其中一个模型
（2）在第一步的模型中间位置的原子上添加一个虚原子，然后复制第一步的模型。你会在主界面窗口的下方预览到模型结构，用鼠标选择模型中间的原子（和虚原子背对背的原子），选中之后它会黄色高亮。 再用鼠标点击建模窗口（也就是你模型所在的大窗口），在虚原子上点鼠标左键，这样连接的时候就会将高亮的原子和虚原子连在一起。
（3）调节虚原子和连接原子之间的距离，也就是你说的平移。
（4）重复第（2）步和第（3）步的操作

作者
Author: tjuptz 时间: 2024-7-4 11:11
::TopoTools::mergemol {0 1 ...} 查一下这个命令

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