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标题: 求助：vmd如何计算配体受体复合物和配体的rmsd [打印本页]

作者
Author: molly85 时间: 2024-5-7 14:51
标题: 求助：vmd如何计算配体受体复合物和配体的rmsd
想问一下vmd中依次输入复合物和配体的pdb文件，是否可以计算复合物中相应的配体部分和单独配体的rmsd。

复合物残基序号：配体部分:430-443；
单独配体残基序号：1-14。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-8 06:17
VMD自带的RMSD Trajectory tool插件里写上恰当的选择语句就完了

VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

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