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标题: 求助:有什么工具或方法,能够提取通过martini3.0力场粗粒化后体系的结合自由能变化? [打印本页]

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Paparazzi灬    时间: 2024-5-7 14:42
标题: 求助:有什么工具或方法,能够提取通过martini3.0力场粗粒化后体系的结合自由能变化?
本帖最后由 Paparazzi灬 于 2024-5-7 14:50 编辑

gmx_mmpbsa等工具似乎只支持AMBER, OPLS, CHARMM等全原子模拟力场,若是使用martini力场进行粗粒化模拟,应该要怎么获得结合自由能等信息呢?

作者
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sobereva    时间: 2024-5-8 06:15
没法实现,据我所知没有适合粗粒化模型的能用于MMPBSA/GBSA目的的隐式溶剂模型
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Paparazzi灬    时间: 2024-5-8 09:06
谢谢老师解答




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