计算化学公社

标题: NBO软件win怎么用 [打印本页]

作者
Author: cym 时间: 2016-11-17 21:42
标题: NBO软件win怎么用
老师，NBO软件win怎么用

作者
Author: sobereva 时间: 2016-11-18 05:11
NBO一种是直接由量化程序调用的，高斯自带的L607模块就属于这种。还一种是可以独立运行的，叫做GENNBO，运行方便，GENNBO 5.0、6.0在论坛里就有
用Gaussian之类程序产生.47文件，这是GENNBO的输入文件，然后用GENNBO载入.47文件就可以计算

作者
Author: 那丢失的 时间: 2016-12-13 16:00

sobereva 发表于 2016-11-18 05:11
NBO一种是直接由量化程序调用的，高斯自带的L607模块就属于这种。还一种是可以独立运行的，叫做GENNBO，运 ...

高斯计算结果
Summary of Natural Population Analysis:

                                    Natural Population
            Natural  -----------------------------------------------
Atom  No Charge       Core    Valence Rydberg    Total
-----------------------------------------------------------------------
   N 1 -0.80841    1.99906    5.77366 0.03569    7.80841
   C 2 0.88733    1.99932    3.08245 0.03091    5.11267
   O 3 -0.44141    1.99972    6.41175 0.02993    8.44141
   S 4 1.17191    9.99906    4.70153 0.12750 14.82809
   O 5 -0.80942    1.99984    6.75390 0.05568    8.80942
=======================================================================
* Total * 0.00000    17.99700 26.72329 0.27971 45.00000

高斯产生.47再用NBO5计算结果
Summary of Natural Population Analysis:

                                 Natural Population                Natural
         Natural --------------------------------------------- Spin
  Atom No Charge       Core    Valence Rydberg    Total    Density
------------------------------------------------------------------------------
N  1 -0.80891    1.99905    5.77330 0.03655    7.80891 -0.00702
C  2 0.88187    1.99932    3.08081 0.03800    5.11813    0.05158
O  3 -0.43770    1.99972    6.41224 0.02574    8.43770    0.04996
S  4 1.17192    9.99906    4.70115 0.12787 14.82808    0.56343
O  5 -0.80719    1.99984    6.75456 0.05278    8.80719    0.34205
===============================================================================
* Total *  0.00000    17.99699 26.72207 0.28094 45.00000    1.00000

计算结果基本没区别啊？这样NBO5计算就没意义啊

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-13 23:24

那丢失的发表于 2016-12-13 16:00
高斯计算结果
Summary of Natural Population Analysis:
...

有的有区别，有的没区别
如果所有都有明显区别，NBO3.1岂不没人敢用了？

作者
Author: 那丢失的 时间: 2016-12-14 08:18

sobereva 发表于 2016-12-13 23:24
有的有区别，有的没区别
如果所有都有明显区别，NBO3.1岂不没人敢用了？

谢谢Sob老师!

作者
Author: my_aman 时间: 2017-8-4 10:45

sobereva 发表于 2016-12-13 23:24
有的有区别，有的没区别
如果所有都有明显区别，NBO3.1岂不没人敢用了？

请问大神，听说高斯计算nbo 可以直接调用opt后chk文件就可以计算了，具体的输入格式是什么样子的呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-8-4 20:48

my_aman 发表于 2017-8-4 10:45
请问大神，听说高斯计算nbo 可以直接调用opt后chk文件就可以计算了，具体的输入格式是什么样子的呢？

意义不明。
高斯里直接调用NBO算就pop=NBO

作者
Author: my_aman 时间: 2017-8-5 16:15

sobereva 发表于 2017-8-4 20:48
意义不明。
高斯里直接调用NBO算就pop=NBO

谢谢大神。
结构用高斯优化后，想接着算NBO。老师说可以直接调用优化得到的chk文件来计算NBO。
刚学量化很多都是自己摸索，有会的请不吝赐教

作者
Author: sobereva 时间: 2017-8-5 22:56

my_aman 发表于 2017-8-5 16:15
谢谢大神。
结构用高斯优化后，想接着算NBO。老师说可以直接调用优化得到的chk文件来计算NBO。
刚学量 ...

chk文件怎么可能算NBO，NBO程序又不支持以chk文件作为输入文件
你的基本逻辑关系还没搞清楚

作者
Author: my_aman 时间: 2017-8-6 10:51
本帖最后由 my_aman 于 2017-8-6 10:54 编辑

sobereva 发表于 2017-8-5 22:56
chk文件怎么可能算NBO，NBO程序又不支持以chk文件作为输入文件
你的基本逻辑关系还没搞清楚

大神，有人按着这个输入文件文件在高斯上算NBO。他们是说直接调用chk 算NBO，但是我按着这种并不行。

作者
Author: my_aman 时间: 2017-8-6 11:22

my_aman 发表于 2017-8-6 10:51
大神，有人按着这个输入文件文件在高斯上算NBO。他们是说直接调用chk 算NBO，但是我按着这种并不行。

不好意思大神，之前我没说清楚。我想问的是这里面的HgCl2-nbo1.chk文件是之前优化得到的chk ??还是自己命名的

作者
Author: sobereva 时间: 2017-8-6 11:59

my_aman 发表于 2017-8-6 11:22
不好意思大神，之前我没说清楚。我想问的是这里面的HgCl2-nbo1.chk文件是之前优化得到的chk ??还是自己 ...

那叫基于之前的chk里的数据作为初猜再做NBO，而不叫“调用chk 算NBO”
这任务实际上都没必要再写基组、赝势，直接用chkbasis就完了

既然都从chk里读数据了，显然得是之前优化等任务产生的。

作者
Author: my_aman 时间: 2017-8-6 12:38

sobereva 发表于 2017-8-6 11:59
那叫基于之前的chk里的数据作为初猜再做NBO，而不叫“调用chk 算NBO”
这任务实际上都没必要再写基组、 ...

关键词里直接加chkbasis吗？？学习了，公社是我等初学者的福音。多谢社长不厌其烦的指教

作者
Author: sobereva 时间: 2017-8-6 21:15

my_aman 发表于 2017-8-6 12:38
关键词里直接加chkbasis吗？？学习了，公社是我等初学者的福音。多谢社长不厌其烦的指教

是

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