计算化学公社

标题: 求助:如何用Lammps计算xy轴的密度分布 [打印本页]

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Author:
chef    时间: 2024-3-31 15:14
标题: 求助:如何用Lammps计算xy轴的密度分布
如图,想求助一下如何计算一下xy轴上的密度分布。本人小白,最好有详细的教程,麻烦了。

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sobereva    时间: 2024-3-31 15:20
我不用lammps,gromacs带的gmx densmap倒是可以直接给出这种图,可以考虑转换下格式后借用

北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)里讲了具体例子
(, 下载次数 Times of downloads: 28)

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MengXH7    时间: 2024-4-1 09:45
VMD可以计算出x、y方向的密度曲线,然后可以根据VMD的TCL脚本导入origin里面画出二维密度云图

作者
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thor    时间: 2024-6-12 19:46
compute chunk/atom bin/2d命令可以输出相应数据
作者
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chef    时间: 2024-6-20 16:42
thor 发表于 2024-6-12 19:46
compute chunk/atom bin/2d命令可以输出相应数据

已解决了,感谢
作者
Author:
打豆豆的灰鸭    时间: 2024-7-3 22:07
chef 发表于 2024-6-20 16:42
已解决了,感谢

请问一下怎么是怎么做的
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s541040349    时间: 2025-4-28 18:20
chef 发表于 2024-6-20 16:42
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请教一下是怎么做的呀




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