计算化学公社

标题: 求助，输入文件中k点只能为6 6 4，否则直接报错 [打印本页]
作者
Author: docshen777    时间: 2024-3-21 17:47
标题: 求助，输入文件中k点只能为6 6 4，否则直接报错
各位老师好，今天遇到一个问题，苦恼了一整天了依然无法解决，想请教大家，事情的起因是我想对自己的模型进行k点收敛性测试，于是用multiwfn生成了inp，用了培训班的脚本，结果发现没法跑，直接报错，报错内容为


Backtrace for this error:

Program received signal SIGSEGV: Segmentation fault - invalid memory reference.


查了资料发现是内存爆了，以为是mpi的问题，于是测试了很久，也没找到问题所在。中途试了一下AIMD的计算，是可以正常进行的。

然后我就测试了sob老师的CdS结构优化的文件，发现可以正常运行，把坐标往下的部分复制到我的模型上，也能正常运行。最后试来试去，发现只有在k点设置为6 6 4的情况下才能正常运行，哪怕是CdS的例子那个文件，改了k点也无法计算了。想请问这是cp2k的问题还是什么bug？我用了之前编译的2023.2和前天编译的2024.1，都有一样的问题。输入文件见附件。

谢谢大家回答！
作者
Author: docshen777    时间: 2024-3-22 19:11
已经重新按照sob老师博文重新安装了cp2k2024.1，但还是有相同问题，k点只能是6 6 4，培训班中所有例子也都是要改成6 6 4才能运行，否则报错...
作者
Author: sobereva    时间: 2024-3-22 20:53
你的运行环境（软或硬件都算）有问题
我在RockyLinux 9用2*7R32 512GB机子跑按下文编译的2024.1 popt版，把你的inp文件改成了6 6 6 k点，我这里毫无问题
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586（http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html）



  2. Number of orbital functions:                                               1609
  3. Number of independent orbital functions:                                   1609

  5. Extrapolation method: initial_guess


  8. SCF WAVEFUNCTION OPTIMIZATION

  10.   Step     Update method      Time    Convergence         Total energy    Change
  11.   ------------------------------------------------------------------------------
  12.      1 NoMix/Diag. 0.40E+00   15.8     1.98633039     -2056.3729205636 -2.06E+03
  13.      2 Broy./Diag. 0.40E+00   15.9     1.69213726     -1958.0982824128  9.83E+01
  14.      3 Broy./Diag. 0.40E+00   15.8     1.93084518     -2066.4653868406 -1.08E+02
  15.      4 Broy./Diag. 0.40E+00   15.7     1.22985921     -2064.2462936454  2.22E+00
  16.      5 Broy./Diag. 0.40E+00   15.7     1.41106404     -2062.1359219886  2.11E+00
  17.      6 Broy./Diag. 0.40E+00   15.7     1.28352511     -2062.2341637042 -9.82E-02
  18.      7 Broy./Diag. 0.40E+00   15.7     1.40831413     -2060.3406222694  1.89E+00
复制代码


作者
Author: docshen777    时间: 2024-3-23 10:04
sobereva 发表于 2024-3-22 20:53
你的运行环境（软或硬件都算）有问题
我在RockyLinux 9用2*7R32 512GB机子跑按下文编译的2024.1 popt版， ...

谢谢sob老师帮我测试。我也一直在debug。我是wsl2的ubuntu环境，想来想去也就这个原因了，准备换虚拟机试试。再次谢谢您！
作者
Author: docshen777    时间: 2024-3-23 15:10
sobereva 发表于 2024-3-22 20:53
你的运行环境（软或硬件都算）有问题
我在RockyLinux 9用2*7R32 512GB机子跑按下文编译的2024.1 popt版， ...

谢谢老师，换了rockylinux9.3已经成功跑起来，WSL是不太行...
作者
Author: JCenter    时间: 2025-7-5 19:01
我也遇到这个问题了，使用k点就直接这个报错（ubuntu）。重装了好几遍，都是这样，我感觉就是openmpi的问题，但是安装openmpi也没异常。



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