计算化学公社
标题:
请教计算以氢键结合的两个分子的静电势是否具有意义?
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作者Author:
sharan1994
时间:
2023-11-2 22:04
标题:
请教计算以氢键结合的两个分子的静电势是否具有意义?
想研究苯酚上羟基形成OH...N形式氢键后,氢键受体分子是否对羟基的反应性有所影响,想着是通过静电势或者
ALIE进行研究。但是查看静电势的绘制教程中都是单分子的静电势图或者两个分子间的静电势穿刺。我做了单个分子和两个分子穿刺的静电势图,提取了羟基中O和H的静电势具体数值,发现是一样的,这样似乎没法体现氢键受体分子对羟基的影响。于是我把两个分子整体进行了静电势计算,得出的O和H的数值发生了较大的变化。但是我不敢确定这样直接算两个分子形成的团簇的静电势是否有意义,想请教下大家:
1:如果我根据对比整体静电势和单个苯酚分子的静电势中羟基的静电势值去说明在氢键受体加入后羟基中的H原子的亲核反应活性降低这样是否正确?
2:如果这样绘制整体的静电势不合理,那有什么方法可以去定量分析这种氢键受体对羟基反应活性的影响?
谢谢!
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苯酚分子和氢键受体形成氢键
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苯酚单体的静电势
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苯酚和氢键受体之间的静电势穿刺图
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苯酚和氢键受体整体的静电势图
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