计算化学公社

标题: CP2K中QS模块下的Method如何选择? [打印本页]

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QEQEIop    时间: 2023-11-1 23:22
标题: CP2K中QS模块下的Method如何选择?
新手提问。如题,QS模块下,能选择的method非常多,这里的选择性有什么讲究吗?比如我需要用分子动力学计算有机分子在过渡金属表面的吸附,用哪一个既能有精确度也能有速度?换体系选择的方法又是什么?还请各位老师指点迷津,非常感谢!
METHOD: enum= GPW

Usage: METHOD GAPW

Valid values:



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sobereva    时间: 2023-11-2 06:24
问题太宽泛。而且诸如GPW和GAPW只是计算形式的大类,具体用的泛函、基组等因素对结果又有关键性影响。各种相关背景知识和使用在北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里有全面、深入、细致的介绍,不是这里几句话能说明白的。

至于你说的那种问题,只能告诉你通常适合以GPW形式做基于DFT的AIMD计算,PBE-D3(BJ)泛函结合DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组通常合适,性价比较高,但没更具体细节没法更准确回答。
作者
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QEQEIop    时间: 2023-11-2 11:42
sobereva 发表于 2023-11-2 06:24
问题太宽泛。而且诸如GPW和GAPW只是计算形式的大类,具体用的泛函、基组等因素对结果又有关键性影响。各种 ...

谢谢Sob老师!
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adong    时间: 2024-1-25 18:07
sobereva 发表于 2023-11-2 06:24
问题太宽泛。而且诸如GPW和GAPW只是计算形式的大类,具体用的泛函、基组等因素对结果又有关键性影响。各种 ...

sob老师,看CP2K手册给的参考文献,PM6-FM提及的是色散和氢键的校正版本,那么对应的是PM6-DH还是PM6-D3H4,具体是哪个版本呢?
作者
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sobereva    时间: 2024-1-26 03:13
adong 发表于 2024-1-25 18:07
sob老师,看CP2K手册给的参考文献,PM6-FM提及的是色散和氢键的校正版本,那么对应的是PM6-DH还是PM6-D3H ...

都不是。而是https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jcc.23887里提出的
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adong    时间: 2024-1-26 10:59
sobereva 发表于 2024-1-26 03:13
都不是。而是https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jcc.23887里提出的

sob老师,那PM6-FM + D3 会比 PM6 + D3 校正对一般有机体系模拟效果好吗?
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lwang2016    时间: 2024-1-26 14:22
一般具体的应用都有相应的文献作为参考的吧
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sobereva    时间: 2024-1-27 03:56
adong 发表于 2024-1-26 10:59
sob老师,那PM6-FM + D3 会比 PM6 + D3 校正对一般有机体系模拟效果好吗?

不会有什么额外优势
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adong    时间: 2024-1-27 21:49
sobereva 发表于 2024-1-27 03:56
不会有什么额外优势

谢谢sob老师
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JCenter    时间: 2025-3-7 00:41
sobereva 发表于 2023-11-2 06:24
问题太宽泛。而且诸如GPW和GAPW只是计算形式的大类,具体用的泛函、基组等因素对结果又有关键性影响。各种 ...

卢老师,我的体系约2200-2500个原子,有机聚合物和水(C\H\O\N)的体系,在cp2k中做FPMD,使用pbe搭配DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组,64核计算。即使开OT,也很慢,体系太大,想跑个20ps。在泛函、赝式基组、体系不变且不损失结果信赖度的情况下需要怎么降低耗时呢,我看讲义中能量部分介绍了两种方法:LSSCF(<6000原子下、无优势,不如不启用)、LRIGPW方法(占用内存巨大),个人看着都不太好,老师您有什么好的建议吗
作者
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sobereva    时间: 2025-3-7 06:17
JCenter 发表于 2025-3-7 00:41
卢老师,我的体系约2200-2500个原子,有机聚合物和水(C\H\O\N)的体系,在cp2k中做FPMD,使用pbe搭配DZV ...

普通的计算条件下只能用GFN1-xTB或GFN0-xTB
作者
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JCenter    时间: 2025-3-7 14:38
sobereva 发表于 2025-3-7 06:17
普通的计算条件下只能用GFN1-xTB或GFN0-xTB

感谢老师




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