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标题: Sobtop 生成阴离子的itp文件失败 [打印本页]

作者
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sxh3231796    时间: 2023-6-26 01:44
标题: Sobtop 生成阴离子的itp文件失败
在做溶剂化模型前想用sobtop生成NTF2阴离子的itp文件,有几个问题不太确定,成功生成gro文件,但在生成top文件的步骤就会被杀掉,看不见报错信息,请问是什么原因啊?对于包含阴阳离子的分子,是要一起计算RESP电荷还是分开计算呢?在//www.bio2byte.be生成的有机中性分子还需要再额外计算RESP电荷吗?
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sobereva    时间: 2023-6-26 04:13
我这里用sobtop产生毫无问题
进入命令行界面再运行sobtop,看崩溃时的报错。说清楚你怎么操作的

显然阴、阳离子的拓扑文件分别用sobtop建立、分别用Multiwfn算RESP电荷
sobtop主页上也都非常明确说了
http://sobereva.com/soft/Sobtop
FAQ 4:离子液体的拓扑文件怎么产生?阴阳离子合在一起处理还是分开处理?

问之前先把sobtop主页完整看一遍

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ccff    时间: 2025-3-30 10:42
我也遇到这个问题,生成gro文件后,在生成itp文件时程序自动杀掉,请问有什么解决方法
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sobereva    时间: 2025-3-31 02:05
ccff 发表于 2025-3-30 10:42
我也遇到这个问题,生成gro文件后,在生成itp文件时程序自动杀掉,请问有什么解决方法

始终拿具体文件说事,并交代完整操作过程




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