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标题: 蛋白质里含有一个砷原子，这个砷原子该用什么力场参数呢？ [打印本页]

作者
Author: 退休老干部 时间: 2023-4-20 15:23
标题: 蛋白质里含有一个砷原子，这个砷原子该用什么力场参数呢？
我想请问一下蛋白质里含有一个砷原子，这个砷原子该用什么力场参数呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-20 17:53
LJ参数借用UFF的参数，相关成键项的力常数可以用sobtop通过量子化学基于簇模型做优化和振动分析后产生的Hessian计算
http://sobereva.com/soft/Sobtop
如果As牵扯到柔性二面角，则需要自己构造模型体系扫描二面角势能曲线并拟合扭转势参数

作者
Author: 退休老干部 时间: 2023-4-20 20:54

sobereva 发表于 2023-4-20 17:53
LJ参数借用UFF的参数，相关成键项的力常数可以用sobtop通过量子化学基于簇模型做优化和振动分析后产生的Hes ...

好的，谢谢老师解答！

作者
Author: zhengzhihao 时间: 2025-3-21 20:53
本帖最后由 zhengzhihao 于 2025-3-21 21:18 编辑

使用multiwfn计算分子色散力时，计算分子色散力没有砷原子的参数，如何处理？

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