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标题: 求助，请问PROPKA程序可以用于预测核酸结构不同pH环境下的电荷和质子化态吗 [打印本页]

作者
Author: duzy 时间: 2023-4-14 17:32
标题: 求助，请问PROPKA程序可以用于预测核酸结构不同pH环境下的电荷和质子化态吗
求助各位前辈老师，请问PROPKA程序可以用于预测核酸结构不同pH环境下的电荷和质子化态吗，这个针对蛋白可以，但是不知道对核酸是否适用？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-15 00:55
不适合核酸

作者
Author: duzy 时间: 2023-4-15 10:58

sobereva 发表于 2023-4-15 00:55
不适合核酸

那请问老师有什么办法可以做到核酸的预测吗

作者
Author: duzy 时间: 2023-4-15 12:37

sobereva 发表于 2023-4-15 00:55
不适合核酸

我还想问一下老师，默认的核酸标准残基所带电荷是中性条件下所带电荷数嘛

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-15 20:08

duzy 发表于 2023-4-15 12:37
我还想问一下老师，默认的核酸标准残基所带电荷是中性条件下所带电荷数嘛

是

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-15 20:09

duzy 发表于 2023-4-15 10:58
那请问老师有什么办法可以做到核酸的预测吗

自己算pKa

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