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标题: 求助：GROMACS模拟锂离子电池中金属和电解液的固液界面 [打印本页]

作者
Author: xjw 时间: 2023-3-29 22:51
标题: 求助：GROMACS模拟锂离子电池中金属和电解液的固液界面
各位老师好，我想模拟锂离子电池中金属和电解液的固液界面，我通过MS得到锂金属的晶面结构，然后再得到电解液的盒子，最后通过packmol将两个盒子叠在一起。请问在进行最小化的时候是要将锂金属的位置进行固定吗？是以什么方式固定啊？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-30 09:38
若无特殊原因，别增加不必要的人为因素，诸如固定

作者
Author: xjw 时间: 2023-3-30 10:16

sobereva 发表于 2023-3-30 09:38
若无特殊原因，别增加不必要的人为因素，诸如固定

感谢老师回复，如果不固定锂金属层在模拟过程中锂原子会不会到处乱跑啊？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-1 05:17

xjw 发表于 2023-3-30 10:16
感谢老师回复，如果不固定锂金属层在模拟过程中锂原子会不会到处乱跑啊？

实际跑起来试试便知

作者
Author: Shuang-Jie 时间: 2024-2-12 17:44
您说的Packmol将两个盒子叠加到一起，具体是怎么叠加的呢？

作者
Author: chuxuedexiaobai 时间: 2024-4-17 21:25
我想问下你这个锂固定了吗，我要固定一个FE面，但是位置限制后NVT仍然跑散了一直不知道怎么解决

作者
Author: xjw 时间: 2024-4-22 13:36

chuxuedexiaobai 发表于 2024-4-17 21:25
我想问下你这个锂固定了吗，我要固定一个FE面，但是位置限制后NVT仍然跑散了一直不知道怎么解决

直接冻结

作者
Author: chuxuedexiaobai 时间: 2024-4-22 20:05

xjw 发表于 2024-4-22 13:36
直接冻结

冻结的话后面就跑不了NPT了吧，不是说冻结不能和npt连用嘛

作者
Author: xjw 时间: 2024-4-23 13:44

chuxuedexiaobai 发表于 2024-4-22 20:05
冻结的话后面就跑不了NPT了吧，不是说冻结不能和npt连用嘛

只能用NVT

作者
Author: hanyu123 时间: 2025-4-7 17:01

xjw 发表于 2024-4-23 13:44
只能用NVT

你好，我想请教一下，我类似的体系冻结表面后，出现了电解液进入到电极侧表面的情况，这种该怎么解决呢？或者能分享一下输入文件吗，万分感谢。

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