计算化学公社

标题: 请问有没有办法度量一个分子的“球形度”？ [打印本页]

作者
Author: UTM 时间: 2023-3-20 00:23
标题: 请问有没有办法度量一个分子的“球形度”？
请问各位老师同学，能否定量的度量一个分子接近球形的程度？比如正戊烷和新戊烷肯定是新戊烷更接近球形，因为正戊烷是长链分子。这种分子接近球形的程度能否通过一个物理量度量？

作者
Author: 妙角不脆 时间: 2023-3-20 02:45
当年学河流沉积颗粒分析的时候学过一个量叫sphericity来衡量接近球形的程度,虽然对象不是分子但是完全可以类比。

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2023-3-20 03:42
或许可以用最小的球包裹特定电子密度形成的分子表面区域，计算分子表面所包含的体积、电子数等物理量占前述球体积的比例。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-20 05:12
Multiwfn（http://sobereva.com/multiwfn）的主功能12做分子表面分析的时候直接就可以给出球形度。原理在Multiwfn手册3.15.1节说了

(, 下载次数 Times of downloads: 16)

Multiwfn启动后，载入mwfn、fch、wfn、molden等含有波函数信息的文件，然后依次输入
12
6
就会构造电子密度=0.001 a.u.的表面，其中输出了球形度

(, 下载次数 Times of downloads: 17)

不知道怎么产生波函数文件的话看
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379（http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html）

作者
Author: UTM 时间: 2023-3-20 11:09

sobereva 发表于 2023-3-20 05:12
Multiwfn（http://sobereva.com/multiwfn）的主功能12做分子表面分析的时候直接就可以给出球形度。原理在Mu ...

好的，谢谢社长。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-21 03:59
专门写了个文章
使用Multiwfn计算分子的球形度（sphericity）
http://sobereva.com/661（http://bbs.keinsci.com/thread-35930-1-1.html）

欢迎光临计算化学公社 (http://ccc.keinsci.com/)