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标题: Gromacs安装问题 [打印本页]

作者
Author: dark_cosmos 时间: 2016-6-19 18:54
标题: Gromacs安装问题
Sob老师，我在虚拟机中尝试安装Gromacs，按照Sob老师的帖子 http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=43 进行安装。首先安装cmake，使用命令./bootstrap;make;make install时候，终端里面显示正常安装，但是到达81%之后，突然停下来了。然后直接死掉了，整个虚拟机无法进入，请问老师这是什么原因，我使用的是Ubuntu系统，Gromacs是最新的5.1.2.谢谢老师！

作者
Author: sobereva 时间: 2016-6-19 22:10
虚拟机怎么无法进入？强行重启虚拟机之后呢？
如果重启之后还能操作，再重新装一次gmx

作者
Author: dark_cosmos 时间: 2016-6-20 15:11

sobereva 发表于 2016-6-19 22:10
虚拟机怎么无法进入？强行重启虚拟机之后呢？
如果重启之后还能操作，再重新装一次gmx

谢谢sob老师。强行重启是可以的。我试了一下，将./bootstrap;make;make install这几个命令分开就可以了。另外安装Gromacs的时候，make -j也很容易死掉，可能虚拟机里面会有这样的情况，建议直接make，其实也很快。最后的make install我安装的时候不给sudo一下权限也会报错（cmake Error at cmake_install.cmake:36 (file):）。这是我在虚拟机中安装的问题，大家可以参考一下。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-6-20 16:03
我用vmware虚拟机一直非常稳定，从没碰见这种情况，其它虚拟机就不好说了

作者
Author: dark_cosmos 时间: 2016-6-20 17:14

sobereva 发表于 2016-6-20 16:03
我用vmware虚拟机一直非常稳定，从没碰见这种情况，其它虚拟机就不好说了

谢谢Sob老师，我使用的电脑是是dell的32核工作站，很可能是-j后使用的核太多出现一些问题。不过现在可以用了，谢谢老师的教程。

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