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标题: CASTEP：Linux下提交“性质”（如能带）计算作业，提示无法打开check文件 [打印本页]

作者
Author: xiaowandouer 时间: 2016-5-27 15:57
标题: CASTEP：Linux下提交“性质”（如能带）计算作业，提示无法打开check文件
CASTEP：Linux下提交“性质”（如能带）计算作业，报错：

Reading continuation data from model file f8_BandStr.check
Error model_continuation: Failed to open file f8_BandStr.check
Current trace stack:
model_continuation
castep

请教大家，这种情况如何解决？

另外，用命令提交作业的时候，如果我设置了构型优化的同时计算能带、态密度等性质，最后也只能给出构型优化的结果，能带等信息给出的都是错误的。之所以这样说，是因为同样的体系我用win版CASTEP做过测试，发现Linux给出的能带信息和win版的不吻合，且win版的更为合理。我猜想Linux下根本没有计算能带等性质。这是不是跟我提交作业时根本就没有提交性质计算的任务有关？换句话说，我如何能在Linux下轻松实现构型优化和性质计算在同一个作业完成？

我提交作业的命令是RunCASTEP.sh -q normal -np 8 jobname

作者
Author: 卡开发发 时间: 2016-5-27 16:41
只要额外产生input的性质计算都得在结构弛豫或单点能完成后保留电荷密度等，然后在相同功能工作目录额外运行一遍这些input，如：

能带计算，RunCASTEP.sh -q normal -np 8 jobname结构优化或单点能完成后，你还得RunCASTEP.sh -q normal -np 8 jobname_BandStr才能进行能带计算。

否则读取的电荷和带结构的信息都是自洽的，因为涉及到的K点不同，所以根本没法按照指定的高对称点形成的Path给出色散关系。DMol3也如此。

作者
Author: xiaowandouer 时间: 2016-5-27 17:57

卡开发发发表于 2016-5-27 16:41
只要额外产生input的性质计算都得在结构弛豫或单点能完成后保留电荷密度等，然后在相同功能工作目录额外运 ...

谢谢你的回复。

按照你的提示，我在构型优化后保留所有文件的情况下重新试了，还是报同样的错误

是不是有些文件不需保留？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2016-5-27 19:03

xiaowandouer 发表于 2016-5-27 17:57
谢谢你的回复。

按照你的提示，我在构型优化后保留所有文件的情况下重新试了，还是报同样的错误

这点我不好说，我不知道你的具体操作和具体输入，也有可能是权限问题造成f8_BandStr.check打不开。

实在不行留下联系方式，我远程看看。

作者
Author: xiaowandouer 时间: 2016-5-28 10:32

卡开发发发表于 2016-5-27 19:03
这点我不好说，我不知道你的具体操作和具体输入，也有可能是权限问题造成f8_BandStr.check打不开。

实 ...

非常抱歉，因为不是自己的服务器，所以登陆还需要些密钥什么的，稍稍麻烦。我先把我的操作步骤说下，您看下是不是有问题，如果还不行就只好麻烦您了

输入文件，我是在win版MS里构建的，就是在setup窗口把参数设好，包括要计算的能带等性质，然后把cell文件和param文件复制到Linux某目录下。在同一目录下，先提交opt的作业，opt完成后再提交性质计算作业，就报f8_BandStr.check打不开的错误了

以下是std_out.txt里的信息：
Checked out license feature: MS_castep_site <v2011.090> [for msi] (1 copy)

rank 0 in job 1  cmm03node03_38090 caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 0: return code 1

以下是Castepexe.log里的信息：
Run Castep: with seedname = f8_BandStr
1464402316    status  new    queued
1464402317    progress             -1
1464402320    status  new    running
1464402323    progress             100
1464402323    message error CASTEP terminated with unknown error status.
1464402323    status  new    failure-completed

作者
Author: 卡开发发 时间: 2016-5-28 12:57
本帖最后由卡开发发于 2016-5-28 14:36 编辑

xiaowandouer 发表于 2016-5-28 10:32
非常抱歉，因为不是自己的服务器，所以登陆还需要些密钥什么的，稍稍麻烦。我先把我的操作步骤说下，您看 ...

你把整个工作目录拷贝到linux看看

作者
Author: xiaowandouer 时间: 2016-5-28 16:07

卡开发发发表于 2016-5-28 12:57
你把整个工作目录拷贝到linux看看

成了！可以算了！我咋就没想到呢！原来是优化完构型，重新设置性质计算参数并保存时，还会产生一个非常重要的*.rcheck文件，将这个拷贝到Linux就可以算了

谢谢卡开发发耐心的回复，帮大忙啦！

作者
Author: 佳佳米 时间: 2017-5-15 09:14

xiaowandouer 发表于 2016-5-28 10:32
非常抱歉，因为不是自己的服务器，所以登陆还需要些密钥什么的，稍稍麻烦。我先把我的操作步骤说下，您看 ...

你好，我也有跟你一样的问题，请问你是怎么解决的？

作者
Author: xiaowandouer 时间: 2017-5-15 09:41

佳佳米发表于 2017-5-15 09:14
你好，我也有跟你一样的问题，请问你是怎么解决的？

见7楼哈。

windows下保存性质计算的任务时会产生一个*.rcheck文件，所以Linux下提交任务时除了需要.param, .cell文件及势函数文件外，还需要一个.rcheck 文件，这些都有了，作业就可以算了。

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