计算化学公社

标题: VASP每个计算任务用多少核比较合适呢 [打印本页]

作者
Author: liu_tiao 时间: 2016-5-5 20:04
标题: VASP每个计算任务用多少核比较合适呢
小弟，用vasp计算，感觉计算速度非常慢。现在每个任务用30核（服务器总共32核），每次跑一个任务，感觉很慢。不知道每个任务少用一些核，同时多跑几个任务是不是效率会更高呢

作者
Author: jiewei 时间: 2016-5-6 10:53
正好，那天南京大学计算中心的人讲过这个问题。我给出如下回答（转自南大计算中心负责人）：
(1)如果前端总线和内存以及硬盘读写数度够快，开启超线程，满CPU运行，注意千万不要跨电脑（节点运行，在下面一条）；
(2)如果前端总线以及内存和硬盘读写数度相对不够，首先关闭超线程，其次预留CPU（比如你有20核，现在用18-19核）。
(3)如果是跨节点运行，尽量少的跨节点进行计算，比如你有三台10核心的电脑，你的CPU设置一般是8，9，10或者就是18，19，20，或者就是28，29，30.这个时候你如果用11核肯定比9核要慢。即使你用的是万兆光钎通讯，一样（千兆并行效率一般在50，万兆铜线在70%，光钎在80%左右，据说infiniband能有90%）。
(4)总之一句话，VASP能一台电脑搞定就一台电脑。

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