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标题: cp2k算纯气相体系，有没有跑aimd的文献（例子） [打印本页]

作者
Author: 吞木木 时间: 2022-5-27 20:56
标题: cp2k算纯气相体系，有没有跑aimd的文献（例子）
最近想用cp2k跑一下纯气相体系，就类似于氢气和氧气反应生成水（水在这个时候按照我的理解是气相条件下的），不知道大家有没有见过cp2k算气相体系的文章，可否提供一下，不胜感激！

之前用cp2k算凝聚态（液态和固态），也知道cp2k在算凝聚态方面有优势，但是根据官方的解释是，cp2k是可以算气相下的物质的。

查阅了一些文献，涉及到cp2k算气相体系的物质的时候，往往都是吸附性计算或者催化计算，就是在这个体系中有凝聚相物质占大多数，气体占少数，暂时我还没有发现用cp2k算纯气相体系的例子，因此想找请教一下各位老师。

最后，其实我是发现了一篇文章（见附件）和纯气相有一丢丢相关的，不过它体系实在是太小了（十几个原子），而且主要是算的光谱，我想要的是通过跑气相条件下的aimd以此来观测轨迹文件中的化学反应历程。

可能cp2k算纯气相体系并没有其他的程序好，或者有什么好的程序也恳请各位老师推荐一下。

万分感激

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-5-27 21:03
纯气相MD比较适合用orca，起码不比CP2K差，至于是不是比CP2K好我就不是太清楚了，起码从用的人数来说应该用的比CP2K多

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-27 21:39
除非算那些原子堆积得非常紧密而且很大的团簇，否则用CP2K算相对于用ORCA只有坏处没有好处。诸如你研究的这种体系，用CP2K跑AIMD效率远低于用ORCA跑AIMD，尤其是用杂化泛函时。所以你也很难找到CP2K算这类体系的文章。

小分子的气相反应的AIMD这类问题都通常建议用ORCA，看下面的例子
使用ORCA做从头算动力学(AIMD)的简单例子
http://sobereva.com/576（http://bbs.keinsci.com/thread-20800-1-1.html）
揭示各种新奇的碳环体系的振动特征
http://sobereva.com/578（http://bbs.keinsci.com/thread-20919-1-1.html）

能算周期性体系的程序一律都能算孤立分子，但相对于专门干这种事的量子化学程序来说，通常是严重不划算、不理想的。

标题里不要自己写[求助]这样的标签，此贴说了http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html

作者
Author: 吞木木 时间: 2022-5-27 22:57

sobereva 发表于 2022-5-27 21:39
除非算那些原子堆积得非常紧密而且很大的团簇，否则用CP2K算相对于用ORCA只有坏处没有好处。诸如你研究的这 ...

谢谢老师的解疑，以后发帖我一定注意规范

作者
Author: 吞木木 时间: 2022-5-27 22:57

wzkchem5 发表于 2022-5-27 21:03
纯气相MD比较适合用orca，起码不比CP2K差，至于是不是比CP2K好我就不是太清楚了，起码从用的人数来说应该用 ...

谢谢老师的回答

作者
Author: Divergence 时间: 2025-3-17 16:47

sobereva 发表于 2022-5-27 21:39
除非算那些原子堆积得非常紧密而且很大的团簇，否则用CP2K算相对于用ORCA只有坏处没有好处。诸如你研究的这 ...

其实我有个疑问，因为气相的MD因为要模拟反应进行，那么周期性很可能是PPP，这种情况下用cp2k和ORCA或者高斯会有很大差别吗？我不是很理解其中区别。如果cp2k算的话是不是需要额外进行一些设置呢

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-3-17 18:46

Divergence 发表于 2025-3-17 16:47
其实我有个疑问，因为气相的MD因为要模拟反应进行，那么周期性很可能是PPP，这种情况下用cp2k和ORCA或者 ...

我觉得取决于具体要研究的气相反应体系，对一两个小分子参与的过程（如3楼链接里提的那些）只用ORCA做非周期性计算即可，而对大量分子参与的燃烧、聚合等复杂过程才需要用CP2K按周期性计算。

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