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标题: 在ubuntu中用lammps跑反应,一直卡在某一步长,但cpu显示该进程还在运行,如何解决? [打印本页]

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njustwjy    时间: 2022-5-10 13:41
标题: 在ubuntu中用lammps跑反应,一直卡在某一步长,但cpu显示该进程还在运行,如何解决?
我在ubuntu中用lammps的reaxFF力场跑铝粉的氧化反应,用8核并行计算,一直卡在1016500步不动(一整天了,不是因为计算慢而没有显示),但后台的cpu进程显示其还在运行,我又看了log文件,发现log文件输出的信息也在1016500不动,请问这种情况该如何解决?谢谢。

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abin    时间: 2022-5-11 08:06
用我提供的版本试试?
盲猜,MPI问题。

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njustwjy    时间: 2022-5-11 09:35
abin 发表于 2022-5-11 08:06
用我提供的版本试试?
盲猜,MPI问题。

谢谢您的回复,我现在这个任务还没关,还是这个步数,我打开监视器,发现这个任务还在占用内存,还在占用cpu,太奇怪了,就是不输出数据。
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mengxiangidea    时间: 2022-5-11 10:58
跑reaxff,一定要把reaxff包和Kokkos package同时打开。
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njustwjy    时间: 2022-5-11 17:29
mengxiangidea 发表于 2022-5-11 10:58
跑reaxff,一定要把reaxff包和Kokkos package同时打开。

谢谢您的建议。
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nickfaker    时间: 2024-9-24 20:47
请问楼主解决这个问题了吗?我在服务器上跑reax也出现了这个问题,一直在运行没有输出。但是我自己电脑跑却没有问题
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lhl161820    时间: 2024-12-30 17:06
nickfaker 发表于 2024-9-24 20:47
请问楼主解决这个问题了吗?我在服务器上跑reax也出现了这个问题,一直在运行没有输出。但是我自己电脑跑却 ...

请问解决了么,我在服务器上跑reax也是这个问题,一直在跑,log文件上显示没输出,但是轨迹文件的步数一直在加,是显示问题么,还是这样会一直跑下去
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1170356417    时间: 2025-4-11 11:04
我在超算上跑reaxff也遇到同样的问题,请问最后是怎么解决的?
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1170356417    时间: 2025-4-11 11:06
abin 发表于 2022-5-11 08:06
用我提供的版本试试?
盲猜,MPI问题。

我也遇到了同样的问题,请问是并行的问题吗?有解决方案吗?
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1170356417    时间: 2025-4-11 11:06
mengxiangidea 发表于 2022-5-11 10:58
跑reaxff,一定要把reaxff包和Kokkos package同时打开。

请问reaxff包怎么打开




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