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标题: AIM分析中关键点（BCP）和键径的关系 [打印本页]

作者
Author: 风飞 时间: 2016-3-22 22:21
标题: AIM分析中关键点（BCP）和键径的关系
本帖最后由风飞于 2016-3-23 08:14 编辑

老师：您好！请问关键点BCP和键径是否有关系？您说过：”有关键点不一定有键径，有键径一定有关键点“，之前了解不恰当的到使用匽示基组时，会使得本该出现键径的地方不会显示键径，请问还会有什么原因会使得两个原子之间存在关键点却不能显示出键径呢？我的原子是Sb原子和Sb原子，Au原子和Au原子，Au原子和Sb原子之间。我使用的基组和方法是b3lyp/def2TZVP. 谢谢！当出现这种有关键点但是却没有键径的时候，我看到有文献中说可以用interaction quantum atoms（IQA)进一步探究,请问这个方法使用的限制（注意事项）和Multwfn中的哪个分析手段呢？谢谢！
老师：您好！计算发现在同一种化合物中的同一个位置的关键点所得的实空间函数值，使用ELF拓扑分析和电子密度拓扑分析所得的值不一样，请问这两者的区别是？我们在使用时怎样去选择呢？谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2016-3-24 00:59
那个不叫关键点，而叫临界点，见：http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=1358
我不记得我说过那句话。有BCP，一定会有对应的键径。
除了用了赝势且没用wfx文件、没有把该找出的(3,-3)都找出，或者产生键径过程中出现数值问题外，一定能产生出键径。
def2TZVP对Sb、Au都是赝势基组。你的情况，用了wfx文件，或者用全电子基组计算，都能得到键径。
有BCP就已经可以考察键的性质了，没必要非有完整的键径。如果是想沿着键径对某些函数作图，而且即便没产生出键径，在Multiwfn里直接对两个原子间连线作图也可以，通常偏离键径很小。
IQA非常昂贵，稍大点的体系都很难做。这和分析BCP完全不是一类思想。
最后一问要看具体情况。

作者
Author: 风飞 时间: 2016-3-24 02:47
本帖最后由风飞于 2016-3-24 10:32 编辑

sobereva 发表于 2016-3-24 00:59
那个不叫关键点，而叫临界点，见：http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=1358
我不记得我 ...

老师：您好！请问您说的看具体情况，指的是？谢谢！抱歉我还有如下问题：
问题1：在老师您的那个使用multiwfn软件计算的文章中的一篇文献中看到，population in the valence basin V(M,M)中计算的到的值在2.0 左右说明是M-M之间是常规的 2中心键，但是如果的小于2，例如V(M,M)=1.4 ，请问这说明什么呢？谢谢！
问题2：请问老师：图片中的椭圆的那两个值是在盆分析中的哪个计算输出的呢?谢谢！
问题3：老师，您说的.Wfx文件是和wfn文件的生成类似吗？高斯输入文件中写上output=wfx.并且在最后空行写上C:    .Wfx    请问是这样的吗？谢谢！
问题4：老师，在闭壳层体系中，该体系临界点的拉普拉斯电子密度为正值，请问我该怎样去比较他键的种类呢？我看到文献中是这个说的”1)▽2ρ<0, Vb<0,Hb大约等于0.......说明是金属键
2）：▽2ρ<0,Vb=<0，Gb=<[Vb];Hb<0    说明是强共价键作用
3）▽2ρ<0,Vb<0，Gb=≈[Vb];Hb=≈0  金属键
4）▽2ρ>0, -Gb/Vb>1       弱非共价键作用。
请问老师，还有其它办法吗？谢谢！问题5：老师：在文献中看到有说Hb用来衡量键的强度，也有说用电子密度ρ来衡量键强度，请问是按照哪个更好些呢？谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2016-4-4 01:07

风飞发表于 2016-3-24 02:47
老师：您好！请问您说的看具体情况，指的是？谢谢！抱歉我还有如下问题：
问题1：在老师您的那个使用mul ...

1 并非非得2左右才是共享一对电子的两中心键。共享几对电子用Mayer键级考察
2 计算定域化与离域化指数，这和你圈出来的量直接相关，关系看手册3.18.5节
3 wfx文件这里有介绍
在赝势下做波函数分析的一些说明
http://sobereva.com/156
是那样生成
4 标准多的很，常用标准之一是看能量密度，两原子间能量密度为负算共价键，这里有介绍
AIM键临界点处电子密度拉普拉斯值符号判断相互作用类型失败原因的图形分析
http://sobereva.com/161
但不同标准给出的将结论有时会有冲突。
5 不同类型的键都没法靠这两个量来比较，这些量只能横向对同类键比较

作者
Author: 风飞 时间: 2016-4-5 10:48

sobereva 发表于 2016-4-4 01:07
1 并非非得2左右才是共享一对电子的两中心键。共享几对电子用Mayer键级考察
2 计算定域化与离域化指数 ...

恩，好的谢谢老师！请问计算出的实空间函数的值：电子密度、拉普拉斯值、动能密度、势能密度等。这些的物理意义是？请问有相关的总结吗？（例如：动能密度越大，说明什么？）百度了一下，都感觉怪怪的，而且感觉文献中也是众说纷纭，被搅乱了。所以，还请老师您答疑解惑，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2016-4-5 12:08

风飞发表于 2016-4-5 10:48
恩，好的谢谢老师！请问计算出的实空间函数的值：电子密度、拉普拉斯值、动能密度、势能密度等。这些的 ...

不要看百度，100%会误导。Multiwfn手册2.6节有这些函数的介绍。那些量看过这些文章肯定也会明白：http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=362

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