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标题: 求助C12H20分子异构体 [打印本页]

作者
Author: wwangyt@tju.edu 时间: 2022-4-2 21:02
标题: 求助C12H20分子异构体
请教各位老师，本人想知道C12H20分子（下图所示）的异构体，先拜读了sob老师的帖子（使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社 (keinsci.com)），之后使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对其进行构象搜索，在实施第一步（用xtb在GFN0-xTB下跑动力学时），温度设为400K，发现分子并未做大幅运动，而后提高温度，分别在1500K，2000K下实施MD，并进行用xtb在GFN2-xTB下跑动力学，去重，高斯优化，在1500K和2000K下均仅得到三种异构体。isomers.xyz、cluster.xyz和优化后高斯输出文件见附件。但是本人查阅相关文献，说此分子有四个异构体，两个顺式，两个反式。麻烦各位老师指教。如果凭借化学直觉和高斯输出文件，我还是倾向于三个。恳请各位老师解答。辛苦了~感恩

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作者
Author: wwangyt@tju.edu 时间: 2022-4-2 22:02
已解决，谢谢各位老师

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