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标题: acpype对FAD生成拓扑文件时报错 [打印本页]

作者
Author:
494085639    时间: 2022-2-21 10:07
标题: acpype对FAD生成拓扑文件时报错
各位老师好我在用教程中的acpype生成拓扑文件时报这个错,下面附了mol2文件和错误 想请教下应该怎么解决============================================================================
| ACPYPE: AnteChamber PYthon Parser interfacE v. 0 0 Rev: 0 (c) 2022 AWSdS |
============================================================================
WARNING: no 'babel' executable, no PDB file as input can be used!
ACPYPE FAILED: [Errno 2] No such file or directory: 'tmp'
Total time of execution: less than a second




作者
Author:
sobereva    时间: 2022-2-21 10:28
改用Sobtop产生GAFF力场的拓扑文件,比acpype好用得多。acpype可以弃了

http://sobereva.com/soft/Sobtop

载入mol2文件,效仿例子照着提示敲几下键盘就轻而易举产生出来了:

(, 下载次数 Times of downloads: 7)

(, 下载次数 Times of downloads: 9)

注意你的N26上的氢的位置明显不对


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494085639    时间: 2022-2-21 11:27
sobereva 发表于 2022-2-21 10:28
改用Sobtop产生GAFF力场的拓扑文件,比acpype好用得多。acpype可以弃了

http://sobereva.com/soft/Sob ...

谢谢老师我根据您给的教程再看一下




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