计算化学公社

标题: 请问nbo输出错误什么原因？ [打印本页]

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Author: dingliping1108 时间: 2016-2-23 13:23
标题: 请问nbo输出错误什么原因？
请问各位老师，我安装了nbo，用说明书里面的文件测试了一下，出现下面的问题，是什么原因呢？命令关键词写NPA时就是下面照片中这个错误。但是命令关键词写NBO时就出现这个错误“FATAL ERROR ENCOUNTERED I/O OPERATION FAILED ”

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作者
Author: sobereva 时间: 2016-2-23 14:58
GENEXE和NBOEXE环境变量你怎么设的？
NBO6.0用的是这个帖子里的么？http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=489

作者
Author: dingliping1108 时间: 2016-2-24 15:17

sobereva 发表于 2016-2-23 14:58
GENEXE和NBOEXE环境变量你怎么设的？
NBO6.0用的是这个帖子里的么？http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod ...

sob老师您好，我是按照那个帖子里面的来写的环境变量，请问gennbo.i8.exe和nbo6.i8.exe是不是两个不同的执行程序？当关键词是NPA时调用gennbo.i8.ex，关键词是NBO时调用nbo6.i8.exe？
我用生成的.47文件，按这个命令"/opt/nbo6/bin/gennbo.i8.exe test.47 | tee test.out" 用NPA关键词调用gennbo时也是同样的错误，“missing $END in $ KINETIC; check input”
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用这个命令"/opt/nbo6/bin/nbo6.i8.exe test.47 | tee test.out"用NBO关键词调用nbo6时就出现下面这个错误。
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作者
Author: sobereva 时间: 2016-2-24 15:53
显然是两个不同的可执行程序。
压缩包里就有nbo6.exe和gennbo6.exe，不知道你的i8是哪来的。
nbo6.exe是挂着量化程序用的，gennbo6.exe是独立运行用的。你用orca调用NBO，不管是NPA还是NBO分析，必须是调用nbo6.exe。

你单独用gennbo6.exe出错大抵是.47文件有问题。

作者
Author: dingliping1108 时间: 2016-2-24 17:28
确实是47文件的问题sob老师，我用test文件夹里面的47文件直接调用gennbo.exe程序试了一下是可以正常运行的。之前我测试用的47文件是orca中给NPA命令后生成的47文件。也就是说，我的nbo6.exe这个执行程序没有安装正确？所以无法生成正确的47文件，也无法将gennbo.exe与orca连用？这个我要怎么找出原因解决呢，有可能是我的mkl环境变量设置不正确吗？那个.i8是买来的nbo里面bin文件夹下的执行文件名字是gennbo.i8.exe

作者
Author: sobereva 时间: 2016-2-24 18:44

dingliping1108 发表于 2016-2-24 17:28
确实是47文件的问题sob老师，我用test文件夹里面的47文件直接调用gennbo.exe程序试了一下是可以正常运行的 ...

跟MKL没关系
尝试用论坛里那个

作者
Author: dingliping1108 时间: 2016-2-26 16:18

sobereva 发表于 2016-2-24 18:44
跟MKL没关系
尝试用论坛里那个

因为nbo有版权问题，所以老板买了一个回来，我看orca手册，这边说产生的47文件可以编辑后用gennbo程序单独计算。请问sob老师，是不是orca产生的47文件都需要稍作修改才能在gennbo里算？我按照手册里给的47文件改了格式，一直报错。 (, 下载次数 Times of downloads: 60)

作者
Author: sobereva 时间: 2016-2-26 19:34
我把甲醛的orca输入输出文件都附在这了，可见直接调用NBO6分析很正常。产生的.47文件也很正常，gennbo计算得到的输出信息gennbo_output.txt也很正常。
所以你先尝试论坛里这个NBO6，ORCA如果不是3.0.3换成3.0.3再试。

作者
Author: dingliping1108 时间: 2016-2-27 11:57
sob老师您好我用您给我的文件里面的47文件单独调用gennnbo出现了同样的问题，missing $END in $KINETIC 。用您甲醛的输入文件用orca的命令来计算可以产生跟您一样的47文件，但是没有nbo的计算结果。之前单独调用gennnbo成功是用的nbo软件里面给的47文件，可以正常算出来。我试按您说的方法再试下orca3.3和论坛里的nbo。

作者
Author: dingliping1108 时间: 2016-3-3 09:25

sobereva 发表于 2016-2-24 18:44
跟MKL没关系
尝试用论坛里那个

sob老师您好我用orca3.0还是同样的问题，后来我把47文件里面的$KINETIC后面的所有东西都去掉之后，再单独调用gennbo可以算出来。

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