计算化学公社

标题: 请问sob老师两个问题(静电势相关) [打印本页]

作者
Author: lastzealot 时间: 2016-2-19 17:46
标题: 请问sob老师两个问题(静电势相关)
看文献时，发现了下面这个图（MEP：molecular electrostatic potential），文献中是计算有机分子同graphene和BN之间的作用，对此图的解释为“The molecular charge distribution remains unperturbed by the interaction between the sheet and the amino acid, but the merging of the charge clouds of the adsorbate and the adsorbent is indicative of affinity of the sheet towards the amino acids. The result reinforces the fact that amino acids get physically adsorbed on the nano-surface and this works in favour of the suitability of the nanosheets ”

首先，请问用Multiwfn如何得到这种MEP图？
第二，从这个图如何才能看出来“charge distribution unperturbed”？有标准吗？

谢谢sob老师。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-2-19 18:47
图呢？

作者
Author: lastzealot 时间: 2016-2-19 20:36
这个图，不好意思，刚才没发上来。感觉挺好看的，在您的作品中很多都有类似的2D/3D的图片，感觉可以增加文章的效果。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-2-19 21:26
1 在GaussView里绘制分子表面静电势填色图的过程
http://sobereva.com/253
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布
http://sobereva.com/196

2 对比分子独立状态MEP分布与形成复合物之后那个分子附近的MEP分布，差别不大就算unperturbed

作者
Author: luwis 时间: 2016-2-20 02:07
慢慢感觉sob，确实是神一样的存在！
我真心祝愿你身体一直健康，无私精神永不懈怠！
这样，我们都有福了。谢谢！

作者
Author: lastzealot 时间: 2016-2-20 10:39

sobereva 发表于 2016-2-19 21:26
1 在GaussView里绘制分子表面静电势填色图的过程
http://sobereva.com/253
使用Multiwfn结合VMD分析和绘 ...

谢谢sob老师。

作者
Author: lastzealot 时间: 2016-2-20 10:41
本帖最后由 lastzealot 于 2016-2-20 11:33 编辑

sobereva 发表于 2016-2-19 21:26
1 在GaussView里绘制分子表面静电势填色图的过程
http://sobereva.com/253
使用Multiwfn结合VMD分析和绘 ...

刚才看着您的教程已经能做出MEP图了。
请问这个MEP静电等值面图一般用来做什么呢？可以说明哪些问题呢？
谢谢sob老师。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-2-20 12:20

lastzealot 发表于 2016-2-20 10:41
刚才看着您的教程已经能做出MEP图了。
请问这个MEP静电等值面图一般用来做什么呢？可以说明哪些问题呢？ ...

看这些
静电势与平均局部离子化能综述合集
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=219

作者
Author: lastzealot 时间: 2016-2-20 13:02

sobereva 发表于 2016-2-20 12:20
看这些
静电势与平均局部离子化能综述合集
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=219

谢谢老师
太给力了

作者
Author: 北极天99 时间: 2016-2-20 13:24

luwis 发表于 2016-2-20 02:07
慢慢感觉sob，确实是神一样的存在！
我真心祝愿你身体一直健康，无私精神永不懈怠！
这样，我们都有福了 ...

我也感觉是，sob老师在，心里感觉很踏实。

作者
Author: lastzealot 时间: 2016-2-20 20:50

luwis 发表于 2016-2-20 02:07
慢慢感觉sob，确实是神一样的存在！
我真心祝愿你身体一直健康，无私精神永不懈怠！
这样，我们都有福了 ...

神是永远不会生病的。

欢迎光临计算化学公社 (http://ccc.keinsci.com/)